Program keahlian adalah sejenis program pendidikan atau pelatihan yang dirancang untuk mengajarkan pengetahuan, keterampilan, dan kompetensi tertentu kepada peserta didik. Program ini biasanya diselenggarakan oleh lembaga pendidikan, seperti sekolah menengah, perguruan tinggi, atau lembaga pelatihan, dan fokus pada bidang atau disiplin tertentu. Di SMK Negeri 2 Manado, terdapat 10 program keahlian yang berbeda, yaitu :